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生物医学大数据中心
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  • (BSP)

     

            甲基化分析服务-亚硫酸氢盐测序法(BSP) 【技术简介】 (1)技术原理 用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。针对要调查的区域设计BSP引物进行PCR扩增,对扩增产物进行测序就可以判断哪些CpG位点发生了甲基化;一般将PCR产物克隆后进行测序成功率会比较高。 (2)技术应用 肿瘤的早期预测、分类分级、预后评估及多种疾病的分析;转录水平分析:位于启动子区域的甲基化一般会抑制转录;细胞凋亡等调控机制的研究。 【服务内容】 根据待测基因序列设计相应引物;基因组DNA的提取和质量检测;亚硫酸氢钠修饰基因组DNA;修饰后DNA纯化回收;根据实验的要求进行BSP或者qMSP实验;实验结果的分析以及向客户提供实验报告。 【客户须知及标本要求】 (1)客户提供:要调查的基因名称、种属,要调查的甲基化区域或位点; (2)样品要求:细胞≥105个;组织≥100mg;全血≥0.5ml;基因组DNA ≥5μg;所有样品建议干冰寄送,保持低温,保证样品质量。

  • 广州华银医学检验中心

     

            集团自2013年开始组建高通量测序平台,严格按照国家卫计委对高通量测序实验室的要求进行规范。该平台定位于科研与临床公共服务应用,与合同单位开放共享。2014年11月由南方医科大学与广州华银医学检验中心有限公司共同成立南方医科大学生物医学大数据研究中心(Bio Med Big Data Center, BMDC),该中心是专注于生物医学大数据的信息采集、研究分析、提取整合、应用转化的公共服务平台。BMDC紧密依托南方医科大学的大规模模式生物、微生物中心和临床资源集成的生物学平台,以及集团先进的高通量测序技术平台。在丁彦青、徐湘民、张镇海、张文清、李金明、周宏伟等权威专家的带领下,汇聚了全国高通量测序及生物信息分析资深研究学者,形成了覆盖医学遗传学、病理学、临床医学、模式生物学、微生物学、生物信息学、卫生统计学等众多领域的强大专家团队。 新一代测序技术帮助众多科研人员取得了举世瞩目的研究成果,而随之产生的海量数据使众多研究者面临考验。基于二代测序的生物医学大数据研究中心,致力于突破二代测序所面临的数据分析等挑战。BMDC围绕地中海贫血和白血病、出生缺陷性疾病、慢性肾病和肝炎、神经性疾病、大肠癌、消化系统疾病,对超大人群体检样本库进行易感基因、分子标记物筛查、大规模遗传学生物突变体筛选等研究,以进一步研究发病机制、风险预警、早期诊断和干预、治疗策略。 BMDC是致力于生物医学各领域的研究与大数据分析,可为各大高校、医院和科研单位提供医学科研项目的实验设计、测序方案和数据分析为一体的一站式服务。同时将开发一批新的大数据在线分析工具,建立疾病大数据库和资源共享平台,更好的为科研人员提供疾病的信息分析和科研项目合作服务。研究中心现有国家杰青2名、青年千人1名、国家优青1名、珠江学者2名,拥有广东省重点实验室1个、广东高校重点实验室2个,相关研究工作在Nature、Cell、PNAS、Blood、Gut等SCI杂志上发表论文100余篇,研究成果获国家科技进步二等奖、广东省科技一等奖等奖项7项,拥有自主研发的生物信息分析技术和软件。此外,集团合作机构已近数千家,并与多所国家重点实验室展开科研合作,在科学研究及成果转化方面积累了丰富的经验。在精准医疗与临床应用方面,2015年实验室通过了国家卫计委关于无创产前基因检测的室间质评,并于2015年获批广州市商务委广州市生物医疗研发外包公共服务平台建设项目,以促进精准医疗基因测序技术的最终临...