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肺癌诊断最新共识——肺癌DNA甲基化的应用

2023-03-03 阅读数:2783

为进一步提高我国早期肺癌诊断水平,尤其是肺结节在早期肺癌诊断、评估中的准确性、规范性,中华医学会呼吸病学分会肺癌学组的专家针对国内肺癌早诊领域实际情况,参考国内外最新研究数据和相关指南,制定了《早期肺癌诊断中国专家共识(2023年版)》,共识中着重介绍了肺癌甲基化在早期肺癌诊断中的应用,为临床医生在早期肺癌诊断方面提供参考,以进一步推动我国早期肺癌诊断工作。



01

背景-肺癌甲基化越来越被临床所认可

肺癌在我国居恶性肿瘤发病与死亡之首,严重危害到人民生命健康。近年来肺癌治疗取得了较大的进展,我国肺癌的 5年生存率也从 16.1%提高到 19.7%[1],但仍有约 75%的患者在诊断时处于肺癌晚期,错过了最佳根治性手术治疗时机[2]。 研究显示早期诊断并完全切除的肺原位腺癌(AIS)及微浸润腺癌(MIA)术后 5年疾病特异性生存率分别为 100% 和 100%[3],早期诊断是提高肺癌预后的关键。


近日,《早期肺癌诊断中国专家共识(2023年版)》中,专栏介绍了肺癌甲基化在癌症早期诊断中的应用,这是肺癌甲基化检测既2019年《肺癌筛查与管理中国专家共识》被列入肺癌筛查共识后再次被列入中国专家肺癌诊断共识当中。说明甲基化检测在肺癌早诊中的应用正不断地深入临床,2021年版《肺癌》教材中也明确把甲基化定位为新型肺癌标志物。


02

2023年共识专栏介绍-肺癌甲基化

DNA 甲基化:DNA甲基化是一种主要的表观遗传修饰,甲基化模式的改变在肿瘤发生发展中起着关键作用[4]。由于DNA甲基化几乎存在于包括癌前病变的肿瘤发生发展全程,因此它可能是癌症早期诊断的理想生物标志物[5]。随着甲基化特异性 PCR 的应用,在许多样本类型的肺癌中,各种异常的基因启动子甲基化被评估为生物标志物[6-11]。    

肺泡灌洗液甲基化检测:国内相关研究显示[12],在肺泡灌洗液中联合SHOX2和RASSF1A甲基化检测对肺癌的总体诊断效率显著高于细胞学检查和血清生物标志物癌胚抗原。另一项研究显示[13]上述两基因甲基化 PCR 联合检测时,任一阳性者肺腺癌、鳞癌检出率分别达到66.0%和90.9%。


血液甲基化检测:采用外周静脉血样本进行靶向 DNA 甲基化测序及深度学习方法,构建肺结节良恶性诊断模型PulmoSeek,用于早期肺癌的诊断效果较好[14]。因此,甲基化在肺癌早期诊断中的应用潜能已受到重视。


03

多省已经推出甲基化检查专项物价收费条码


04

华银康-CEECR肺癌早诊

华银康CEECR(Comprehensive Evaluation of Early-Stage Cancer Risks)肺癌早期综合诊断项目,是在应用国内最新肺癌早期筛查诊断技术-甲基化技术的基础上,结合南方医科大学国内顶尖的病理诊断平台及专家资源,为患者提供全面、综合、专业、精准的肺癌早期综合性诊断,适用于各种类型标本(肺泡灌洗液、胸水、刷检液、痰液、组织、血液等),面向呼吸科、胸外科、体检科等科室。


华银康肺癌早期综合诊断项目共有四个套餐

套餐

1

标本类型:刷检液、冲洗液、肺泡灌洗液、胸水、痰液等

甲基化+病理:SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测(FQ-PCR)、 脱落细胞学检查、 细胞蜡块病理检查。


套餐

2

标本类型:10mL外周血保存于游离DNA保存管;

高通量测序(NGS):包含200个甲基化区域,1000个位点,无创、精准评估肺结节早期风险。


套餐

3

标本类型:10mL外周血保存于游离DNA保存管;

FQ-PCR甲基化检测:包含SHOX2、RASSF1A、Septin9、HOXA9、Ptger4,5个基因甲基化检测。


套餐

4

标本类型:刷检液、冲洗液、肺泡灌洗液、胸水、组织、痰液等;

体液甲基化检测(FQ-PCR):SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测。



其中套餐1适用于肺泡灌洗液、胸水等临床体液标本,提供甲基化+细胞病理的整合式评估。套餐2和套餐3使用血液标本,分别采用NGS、Q-PCR进行检测,对于取材不便的肺结节阳性患者, 可选用全血检测评估早癌风险,全面覆盖所有类型人群。套餐4使用肺泡灌洗液、胸水等临床体液标本,也可以使用组织标本,提供单甲基化检测,可对活检标本进一步的确认,让阴性结果更确信,阳性结果不漏诊,避免二次纤维支气管镜或胸穿。


甲基化辅助诊断临床案例分享

临床病史:患者:男, 76岁,因”咳嗽、咳痰半年, 咳痰带血4天” 为主诉入院。初步诊断:初步诊断右肺上叶占位病变,恶性可能性大,建议增强CT检查。


2022-5-7,患者行纤支镜检查,右肺上叶B1支气管粘膜肿胀、亚段肿胀样狭窄, 考虑右肺上叶支气管肿瘤可能性大,进一步取活检组织、灌洗液,并行刷片、TBNA涂片,病理检查结果均提示为良性病变。

SHOX2、 RASSF1A甲基化强阳性,提示肿瘤的可能性非常大,提示进一步穿刺活检以明确诊断。与患者沟通后, 2022-5-13, CT引导下对右肺上叶肿物行皮下穿刺活检, 组织病理检查最终诊断为肺鳞癌。


小结:病理是诊断的金标准,也是临床医师判断手术方式和治疗方法的依据。该病例在最初诊断过程中,纤支镜下细胞与组织病理检查均提示为良性病变,而灌洗液的甲基化检测为强阳性,与患者沟通后,进一步行CT引导下的经皮穿刺,证实为肺鳞癌。


甲基化检测作为一种分子病理项目,可作为形态病理的有力补充,为下一步经皮穿刺活检提供诊断依据,大大缩短患者的诊断时间,同时避免漏诊。


参考文献

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[2] Hong QY, Wu GM, Qian GS, et al. Prevention and management of lung cancer in China[J]. Cancer, 2015, 121 Suppl 17: 3080?3088. DOI: 10.1002/cncr.29584.

[3]Yotsukura M, Asamura H, Motoi N, et al. Long?term prognosis of patients with resected adenocarcinoma in situ and minimally invasive adenocarcinoma of the lung[J]. J Thorac Oncol, 2021, 16(8):1312?1320. DOI: 10.1016/j.jtho.2021.04.007.

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[5] Esteller M, Herman JG. Cancer as an epigenetic disease:DNA methylation and chromatin alterations in human tumours[J]. J Pathol, 2002, 196(1): 1?7. DOI: 10.1002/path.1024.

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[9] Mikeska T, Bock C, Do H, et al. DNA methylation biomarkers in cancer: progress towards clinical

implementation[J]. Expert Rev Mol Diagn, 2012, 12(5):473?487. DOI: 10.1586/erm.12.45.

[10] Feinberg AP, Ohlsson R, Henikoff S. The epigenetic progenitor origin of human cancer[J]. Nat Rev Genet,2006, 7(1):21?33. DOI: 10.1038/nrg1748.

[11] Yu L, Liu H, Yan M, et al. Shox2 is required for chondrocyte proliferation and maturation in proximal limb skeleton[J]. Dev Biol, 2007, 306(2): 549?559. DOI:10.1016/j.ydbio.2007.03.518.

[12] Zhang C, Yu W, Wang L, et al. DNA Methylation Analysis of the SHOX2 and RASSF1A Panel in Bronchoalveolar Lavage Fluid for Lung Cancer Diagnosis[J]. J Cancer, 2017, 8(17):3585?3591. DOI: 10.7150/jca.21368.

[13] 陈瑞英, 刘雅, 孙婷, 等 . 支气管肺泡灌洗液中 SHOX2 和RASSF1A基因甲基化检测对肺癌的诊断价值[J].郑州大学学报(医学版), 2019, 54(5): 732?736. DOI: 10.13705/j.issn.1671?6825.2019.03.005.

[14] Liang W, Chen Z, Li C, et al. Accurate diagnosis of pulmonary nodules using a noninvasive DNA methylation test[J]. J Clin Invest, 2021, 131(10): e145973. DOI:10.1172/JCI145973