技术介绍

       m6A是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式，该甲基化过程通过Writers（m6A甲基转移酶）、Erasers（去甲基化酶）和Readers（识别甲基化酶）的调控作用在腺嘌呤A的第6位氮原子上，具有影响基因表达、RNA剪接、RNA稳定和蛋白翻译等功能。

       meRIP-Seq是目前分析m6A修饰分布的最常用测序技术，该方法将抗体依赖性m6A修饰区域富集与高通量测序相结合，可以高效地在全转录组范围内检测m6A的存在。

应用方向

1.构建全转录组m6A修饰图谱；
2.识别m6A修饰富集区域及其关联基因；
3.分析m6A修饰差异区域及其关联基因；
4.与转录组、翻译组、蛋白组等组学数据关联分析，挖掘m6A影响基因功能的具体机制。

技术优势
1.样品起始量低：
       Total RNA起始量低至20μg。
2.全转录组信息覆盖：
       获得全转录组范围m6A修饰富集区域及其关联基因信息。
3.先进的测序平台：
       采用DNBSEQ技术测序平台，结果更可靠。
4.一站式服务：
       提供样品处理、建库、测序和分析的全套服务，更可以提供多组学联合分析。

技术流程

样本来源：人、大鼠和小鼠（其他样本类型请咨询）。
1.新鲜或冻存组织样本≥10mg；
2.新鲜或冻存细胞系样本≥107cell；
3.RNA总量≥20μg，浓度≥200ng/μL。

实测数据

经典案例

       本文利用m6A-meRIP-seq技术获得了21个胎儿组织m6A分布图谱，确定了m6A的组织间差异以及这种差异对组织特异性基因功能的影响，证明m6A与组织内关键基因稳定性正相关；

       除了mRNA，本文还详细报道了lincRNA中m6A分布特点，发现增强子lincRNA富含m6A修饰；组织上m6A修饰区域通常富含与常见疾病数量性状和复杂性状表达相关的SNP，这可能会影响m6A修饰；最后，发现m6A修饰优先占据富含CpG启动子的基因。总之，本研究揭示了m6A过程受到遗传变异和启动子的广泛调节，以及在人类发育和疾病中的广泛参与而起到重要作用。

图 3 通过比较DNA甲基化、METTL3 TAP ChIP-Seq和meRIP-Seq数据，发现多个m6A富集基因的启动子区内CpG岛和METTL3富集区域一致，提示RNA的转录后修饰可能与其他的表观遗传调控机制存在关联，也提示了meRIP-Seq数据与其他组学数据进行多组学分析的重要性

参考文献：Xiao S, Cao S, Huang Q, et al. The RNA N6-methyladenosine modification landscape of human fetal tissues[J]. Nature cell biology, 2019, 21(5): 651-661.