CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation, CUT&Tag）是替换传统的ChIP-Seq用以研究DNA与蛋白互作的革新技术。在实验过程中无需甲醛交联、超声打断、末端修复和连接接头等操作，通过对细胞预处理、免疫共沉淀、文库构建等关键过程进行技术改进，对ChIP-Seq技术进行全面革新，成为DNA-蛋白互作研究的最佳选择。

技术路线

实测数据

技术优势

1.无需甲醛交联，去交联、DNA打断、标记，实验周期更短；
2.信噪比更高，细胞需求量大大降低；
3.重复性好，信号富集强；
4.能对极少量细胞甚至单细胞进行分析。

技术应用

1.蛋白质-DNA互作研究；
2.检测基因组上的组蛋白修饰，鉴定超级增强子；
3.检测基因组的开放染色质，鉴定转录因子结合图谱；
4.绘制核小体，RNAPII等蛋白的染色质图谱。

案例解析

      ATAC-seq + CUT&Tag联合应用，揭示肿瘤免疫逃逸新机制:

      2020年1月13日，北京大学系统生物医学研究所尹玉新课题组在国际免疫学领域期刊Nature immunology（IF：23.53）在线发表了题为The phosphatase PAC1 acts as a T cell suppressor and attenuates host antitumor immunity[1]的研究论文，采用ATAC-seq和 CUT&Tag测序，揭示了磷酸酶PAC1作为T淋巴细胞功能抑制因子，减弱宿主细胞免疫监视功能，促进肿瘤免疫逃逸的作用机制；抑制PAC1通路，可以激活T淋巴细胞的防御功能。该研究利用ATAC-seq数据得到染色质开放性的动态变化，联合CUT&Tag或ChIP-seq（DNA-蛋白质互作研究金标准）分析，进一步明确调控某一生物学过程的关键因子（包括顺式调控元件和转录因子等）的作用方式，为肿瘤治疗提供了潜在的新型药物靶点，具有重要意义。

PAC1在ROS介导的肿瘤浸润淋巴细胞功能障碍中的作用模型

[1]Dan Lu, Liu L, Sun Y, Song J, Yin Q, Zhang G, Qi F, Hu Z, Yang Z, Zhou Z, Hu Y, Zhang L, Ji J, Zhao X, Jin Y, McNutt MA, Yin Y. The phosphatase PAC1 acts as a T cell suppressor and attenuates host antitumor immunity. Nat Immunol. 2020 Mar;21(3):287-297. doi: 10.1038/s41590-019-0577-9. Epub 2020 Jan 13. PMID: 31932812.